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多肽合成
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荧光标记多肽

 荧光染料光谱列表
染料名称 Excitation(nm) Emission(nm) 分子量 备注信息
Reactive and conjugated probes
Hydroxycoumarin 325 386 331 Succinimidyl ester
Aminocoumarin 350 445 330 Succinimidyl ester
Methoxycoumarin 360 410 317 Succinimidyl ester
Cascade Blue (375);401 423 596 Hydrazide
Pacific Blue 403 455 406 Maleimide
Pacific Orange 403 551    
Lucifer yellow 425 528    
NBD 466 539 294 NBD-X
R-Phycoerythrin (PE) 480;565 578 240k  
PE-Cy5 conjugates 480;565;650 670   aka Cychrome, R670, Tri-Color,
Quantum Red
PE-Cy7 conjugates 480;565;743 767    
Red 613 480;565 613   PE-Texas Red
PerCP 490 675   Peridinin chlorphyll protein
TruRed 490,675 695   PerCP-Cy5.5 conjugate
FluorX 494 520 587 GE Healthcare
Fluorescein 495 519 389 FITC; pH sensitive
BODIPY-FL 503 512    
TRITC 547 572 444 TRITC
X-Rhodamine 570 576 548 XRITC
Lissamine Rhodamine B 570 590    
Texas Red 589 615 625 Sulfonyl chloride
Allophycocyanin (APC) 650 660 104k  
APC-Cy7 conjugates 650;755 767   PharRed
Alexa Fluor系列荧光染料
Alexa Fluor 350 343 442 410  
Alexa Fluor 405 401 421 1028  
Alexa Fluor 430 434 540 702  
Alexa Fluor 488 499 519 643 QY 0.92
Alexa Fluor 500 503 525 700  
Alexa Fluor 514 517 542 714  
Alexa Fluor 532 530 555 724 QY 0.61
Alexa Fluor 546 561 572 1079 QY 0.79
Alexa Fluor 555 553 568 1250 QY 0.1
Alexa Fluor 568 579 603 792 QY 0.69
Alexa Fluor 594 591 618 820 QY 0.66
Alexa Fluor 610 610 629 1285  
Alexa Fluor 633 632 648 1200  
Alexa Fluor 647 652 668 1300 QY 0.33
Alexa Fluor 660 663 691 1100  
Alexa Fluor 680 680 702 1150  
Alexa Fluor 700 696 719 1400  
Alexa Fluor 750 752 776 1300  
Alexa Fluor 790 782 804 1750  
Cy系列荧光染料
Cy2 489 506 714 QY 0.12
Cy3 (512);550 570;(615) 767 QY 0.15
Cy3B 558 572;(620) 658 QY 0.67
Cy3.5 581 594;(640) 1102 QY 0.15
Cy5 (625);650 670 792 QY 0.28
Cy5.5 675 694 1128 QY 0.23
Cy7 743 767 818 QY 0.28
核酸相关探针染料
Hoechst 33342 343 483 616 AT-selective
DAPI 345 455   AT-selective
Hoechst 33258 345 478 624 AT-selective
SYTOX Blue 431 480 ~400 DNA
Chromomycin A3 445 575   CG-selective
Mithramycin 445 575    
YOYO-1 491 509 1271  
Ethidium Bromide 493 620 394  
Acridine Orange 503 530/640   DNA/RNA
SYTOX Green 504 523 ~600 DNA
TOTO-1, TO-PRO-1 509 533   Vital stain, TOTO: Cyanine Dimer
TO-PRO: Cyanine Monomer
Thiazole Orange 510 530    
Propidium Iodide (PI) 536 617 668.4  
LDS 751 543;590 712;607 472 DNA (543ex/712em), RNA (590ex/607em)
7-AAD 546 647   7-aminoactinomycin D, CG-selective
SYTOX Orange 547 570 ~500 DNA
TOTO-3, TO-PRO-3 642 661    
DRAQ5 647 681,697 413 usable excitation down to 488
细胞功能探针
Indo-1 361/330 490/405 1010 AM ester. Low/High Ca++,
Fluo-3 506 526 855 AM ester. pH > 6
DCFH 505 535 529 2'7'Dichorodihydrofluorescein, oxidized form
DHR 505 534 346 Dihydrorhodamine 123, oxidized form,
light catalyzes oxidation
SNARF 548/579 587/635   pH 6/9
荧光蛋白
        QY BR PS  
Y66H 360 442          
Y66F 360 508          
EBFP 380 440   0.18 0.27   monomer
EBFP2 383 448     20   monomer
Azurite 383 447     15   monomer
GFPuv 385 508          
T-Sapphire 399 511   0.60 26 25 weak dimer
Cerulean 433 475   0.62 27 36 weak dimer
mCFP 433 475   0.40 13 64 monomer
ECFP 434 477   0.15 3    
CyPet 435 477   0.51 18 59 weak dimer
Y66W 436 485          
mKeima-Red 440 620   0.24 3   monomer
TagCFP 458 480     29   dimer
AmCyan1 458 489   0.75 29   tetramer
mTFP1 462 492     54   dimer
S65A 471 504          
Midoriishi Cyan 472 495   0.9 25   dimer
Wild Type GFP 396,475 508 26k 0.77      
S65C 479 507          
TurboGFP 482 502 26 k 0.53 37   dimer
TagGFP 482 505     34   monomer
S65L 484 510          
Emerald 487 509   0.68 39 0.69 weak dimer; (Invitrogen)
S65T 488 511          
EGFP 488 507 26k 0.60 34 174 weak dimer
Azami Green 492 505   0.74 41   monomer
ZsGreen1 493 505 105k 0.91 40   tetramer
TagYFP 508 524     47   monomer
EYFP 514 527 26k 0.61 51 60 weak dimer
Topaz 514 527     57   monomer
Venus 515 528   0.57 53 15 weak dimer
mCitrine 516 529   0.76 59 49 monomer
YPet 517 530   0.77 80 49 weak dimer
TurboYFP 525 538 26 k 0.53 1.65   dimer
ZsYellow1 529 539   0.65 13   tetramer
Kusabira Orange 548 559   0.60 31   monomer
mOrange 548 562   0.69 49 9 monomer
mKO 548 559   0.60 31 122 monomer
TurboRFP 553 574 26 k 0.67 62   dimer
tdTomato 554 581   0.69 95 98 tandem dimer
TagRFP 555 584     50   monomer
DsRed monomer 556 586 ~28k 0.1 3.5 16 monomer
DsRed2 ("RFP") 563 582 ~110k 0.55 24    
mStrawberry 574 596   0.29 26 15 monomer
TurboFP602 574 602 26 k 0.35 26   dimer
AsRed2 576 592 ~110k 0.21 13   tetramer
mRFP1 584 607 ~30k 0.25     monomer
J-Red 584 610   0.20 8.8 13 dimer
mCherry 587 610   0.22 16 96 monomer
HcRed1 588 618 ~52k 0.03 0.6   dimer
Katusha 588 635     23   dimer
mKate (TagFP635) 588 635     15   monomer
TurboFP635 588 635 26 k 0.34 22   dimer
mPlum 590 649   0.10 4.1 53  
mRaspberry 598 625   0.15 13   monomer; faster photobleach than mPlum
其他探针
Monochlorobimane 380 461 226 Glutathione probe
Calcein 496 517 623 pH > 5
                                                
单荧光修饰

N端、Lys或Cys巯基: FAM、FITC、TAMRA、Bodipy、Cy5、Cy7
N端或Lys侧链: DansylChlorde、Mca、Dabcyl、Dnp、CarboxyRhodamine110、7OHCCA、Tide Fluor 系列、Alexa Fluor 系列、Texas Red、QSY系列、Atto 系列
Cys巯基:DACIA、Farnesyl
Glu、Asp侧链或者C端:Edans

双荧光修饰 (FRET peptide)
Dabcyl+Edans             Mca+Dnp              FITC+5FAM              5FAM+TQ2      
Cy5+QSY21                6FAM+QSY9         5TAMRA+QSY7       DNP+DACIA
5FAM+Farnesyl          Tide Fluor 555+Tide Fluor 647                Tide Fluor 488+Tide Flour550


 

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